申请保密专利的主要步骤和注意事项如下:申请人需确定其发明或实用新型专利申请是否涉及国家安全或重大利益需要保密。申请人应在提出专利申请的同时,在请求书上提出保密请求。申请人也可以在发明专利申请作好公布准备之前,或者实用新型专利申请作好授权公告